

Desde 2003, el IMSP dispone de la Certificación ISO 9001/2000, renovada en 2006 y en 2009, en los siguientes procesos:
Asimismo, y conforme al derecho a la información medioambiental de los ciudadanos, desde el año 2000, el IMSP publica en la Web del Ayuntamiento de Zaragoza, los datos de calidad de agua de la ciudad de Zaragoza, que se actualizan semanalmente.
Los laboratorios de Análisis Instrumental, Microbiología y Físicoquímica de Alimentos del Instituto Municipal de Salud Pública están acreditados por la Empresa Nacional de Acreditación y Certificación (ENAC) con el nº 304/LE605 y el 304/LE 755 para la realización de "Análisis instrumental de agua y alimentos ".
Una acreditación es para un laboratorio aval de garantía técnica, seguridad y fiabilidad, y es ENAC, el único organismo existente en España con potestad de concedar acreditaciones. La acreditación supone un prestigio para el laboratorio y para el Ayuntamiento de Zaragoza.
Los alcances de acreditación se pueden consultar en http://www.enac.es